wTaskTasks

wTask预定义任务

任务类型

1. bio

生信数据分析相关任务

1. atac_occo: 利用ATAC数据，分析随着时间变化的CO和OC区域。说明文档

2. callpeak_after_mergebam: 将Bam文件Merge起来后，重新call peak。说明文档

3. cluster_kmeans: 将表格数据按照列聚类K-Means聚类。说明文档

4. correlation_python: 利用python计算样本的相关性，会根据样本标签和样本分别做相关性，即每个样本之间的相关性和每类样本之间的相关性。说明文档

5. correlation_seurat: 利用Seurat计算样本的相关性，会根据样本标签和样本分别做相关性，即每个样本之间的相关性和每类样本之间的相关性。说明文档

6. deg_deseq2: 利用DeSeq2计算差异表达基因，DeSeq2利用counts文件计算差异表达基因。说明文档

7. download_from_arrayexpress: ArrayExpress数据下载。说明文档

8. download_from_geo: 根据GEO ID从GEO下载数据。说明文档

9. download_from_link: 根据文件链接列表下载。说明文档

10. enrichment_plot: 根据富集分析结果，挑选需要的term画图。说明文档

11. expression_heatmap: 基因表达热图。说明文档

12. gene_enrichment: 根据基因列表文件进行GO和KEGG富集。说明文档

13. gene_regions: 获取基因对应的region。说明文档

14. gene_venn: 计算不同基因之间的交集，每个文件内的基因为一类，两两做交集。说明文档

15. region_changes: 计算不同类别之间变化的相关性：散点的密度图。说明文档

16. region_enrichment: 使用regionR计算不同Region之间的富集程度。说明文档

17. region_motif: 利用homer查找motif。说明文档

18. region_motif_from_peak: 使用peak和summit，利用homer查找motif。说明文档

19. region_signal_profile: 计算region上面不同bigwig的信号值分布。说明文档

20. region_signal_profile_center: 计算region中间位置两边不同bigwig的信号值分布。说明文档

21. region_specific: 计算不同Region之间的区别。说明文档

22. region_specific_withrep: 计算两类Region之间的区别，每类Region有多个重复。说明文档

23. tad_change: 利用HiCExplorer结果，根据domain.bed计算TAD的变化：Unchanged、Separation、Fusion、EquilongShift、UnilateralShift、Resharp。说明文档

2. yb

医保风控相关任务

1. wstatistics_export: 导出数据库数据。说明文档

2. wstatistics_rule: 通用规则预筛选。说明文档

3. wstatistics_sql: 直接运行sql筛选。说明文档

3. dev

服务器运维相关任务

1. base_monitor: 服务器资源监控：CPU/内存/硬盘/IP。说明文档

2. disk_monitor: 使用du命令监控用户硬盘占用。说明文档

4. spider

爬虫相关任务

1. cis_calendar: CIS学术会议提醒。说明文档

2. westlake_news: 昨日新闻提醒。说明文档

5. tool

其它工具任务

1. img_to_gif: 将批量PNG/JPG/JPEG图片转为GIF。说明文档

2. power_rename_links: 批量文件重命名。说明文档

3. wait_cmd: 等待其它程序完成后再运行命令。说明文档

4. zip_dir: 将文件夹内的所有数据压缩为zip，方便下载数据。说明文档

使用

利用wTask平台运行任务

作者

winter winter_lonely@foxmail.com