Program nelze spustit mimo adresář z gitu

Mám na PC složku, ve které mám soubor CURRENT.cyp s OSTRAJava programem. Složku staženou z githubu jsem si dal do /usr/lib/OSTRAJava, aby byla přístupná odkudkoliv. Na kompilaci jsem si vytvořil jednoduchý skript:

#!/bin/sh

clear
echo "\n\n\nKompiluji..."

cesta=$(pwd)
cd /usr/bin/OSTRAJava/
./ostrajavac -d "$cesta/" "$cesta/CURRENT.cyp" "$cesta/znaky.txt"

echo "Spouštím..."

./ostrajava "$cesta/"

Ve složce $cesta mám soubor, ze kterého chcu, aby OJ četla. Problém je, že program ostrajava sice spouští program ve složce $cesta, ale spouští ho z adresáře /usr/bin/OSTRAJava/. A program $cesta tudíž na soubor v adresáři $cesta nevidí.
Mohl bych příkaz ./ostrajava "$cesta/" nahradit příkazy cd "$cesta" a /usr/lib/OSTRAJava/ostrajava ., jenže program ostrajava má očividně nějaké podivné závislosti.

Jak to mám vyřešit? Nesouvisí s tímto problémem trochu toto?
Děkuji

Tl;dr
Relativní cesty v programu se nepočítají od místa, kde daný program je, ale od místa, kde je stažený OJ interpreter.